斗罗大陆3龙王传说故事结束一万年后，冰化了，斗罗联邦科考队在极北之地科考时发现了一个有着金银双色花纹的蛋，用仪器探察之后，发现里面居然有生命体征，赶忙将其带回研究所进行孵化。蛋孵化出来了，可孵出来的却是一个婴儿，和人类一模一样的婴儿，一个蛋生的孩子。
主角团聚集威尼斯参加世界学府大赛的故事。
最近一段时间，动物城里诡异事件接连上演——织布鸟公寓幽灵出没、鹿灵灵在舞台上意外晕倒、被绑架者凭空消失、世纪名画喵娜丽莎离奇失踪、鲸鱼岛的神秘传说悄然成真……这一切难道只是巧合吗？市民们人心惶惶，不过
